日本熊本縣強震重創九州地區產業運作，半導體、汽車、電子、食品及製造業等多家企業相繼暫停生產。由於熊本近年已成為日本半導體產業重鎮，業界憂心，若停工時間延長，恐衝擊日本半導體供應，並進一步波及汽車等高度依賴晶片的製造業。
亞洲新聞聯盟報導，熊本縣聚集多家半導體相關企業。半導體廣泛應用於汽車、電子設備及各類工業產品，一旦供應中斷，影響將迅速擴及全國製造業。
日本半導體大廠瑞薩電子（Renesas Electronics）地震後已停止熊本市川尻工廠及熊本縣錦町錦工廠運作。兩座工廠主要生產車用半導體等產品，目前已確認廠內出現天花板掉落及漏水情況，正全面檢查生產設備。
三菱電機（Mitsubishi Electric）位於合志市與菊池市的功率半導體工廠也已停工；索尼集團（Sony Group）則停止菊陽町影像感測器工廠生產，東京威力科創（Tokyo Electron）位於合志市及大津町的半導體製造設備工廠同樣暫停運作。
自全球最大晶圓代工廠台積電（TSMC）於 2021 年宣布赴熊本設廠後，眾多半導體供應鏈企業陸續進駐，使熊本半導體產業規模及對地方經濟的重要性較 2016 年熊本地震時進一步提升，周邊住宅與商業設施也隨人口增加持續開發。
台積電 30 日針對受地震影響的菊陽町工廠發表聲明表示，目前仍持續進行製造設備檢查與校正，但相關作業仍需一段時間才能完成。
肥後銀行旗下研究機構去年 12 月公布的預估指出，熊本縣 2026 財政年度名目縣內生產毛額可望達到 7.12 兆日圓，較前一年度成長 2.5%，創歷史新高。其中，台積電第二座工廠持續興建，被視為帶動半導體產業與地方經濟成長的重要動能。
第一生命經濟研究所首席經濟學家永濱利廣表示，包括熊本在內的九州向來被稱為「矽島」，聚集大量半導體工廠，供應鏈遍及日本各地；一旦工廠停擺，汽車等仰賴半導體的產業將難以避免受到衝擊。
日本產業界過去已有類似經驗。2011 年東日本大震災造成瑞薩電子茨城縣那珂工廠受損，車用電子控制半導體一度短缺，迫使全球多家汽車製造商暫停或縮減生產。
除半導體外，其他製造業也受到地震影響。本田（Honda）宣布，大津町熊本機車工廠因廠內漏水與積水，需要進行修復，自 30 日起停工至 31 日，是否於下週恢復生產將視災後狀況決定。2016 年熊本地震後，該工廠歷時近 5 個月才恢復至災前產能。
山葉發動機（Yamaha Motor）旗下 Yamaha Marine 位於熊本縣的兩座工廠也於 30 日停工，其中八代工廠並確認出現土壤液化現象。
普利司通（Bridgestone）已停止玉名市工廠生產，該廠主要製造建設機械使用的橡膠製品；日本製紙（Nippon Paper Industries）八代工廠因煙囪倒塌並造成傷亡，目前仍無法確定復工時間。
三得利控股（Suntory Holdings）則暫停位於嘉島町的九州熊本工廠運作。由於啤酒及飲料產品主要由該廠出貨，目前部分產品已停止或延後配送，公司正評估改由其他生產據點供貨。2016 年熊本地震後，該廠約花費一年半才恢復正常生產與出貨。
清潔用品企業 Duskin 位於御船町的熊本中央工廠因部分建築與設備受損，自 30 日起停工，31 日也不會恢復營運，原本負責的拖把及地墊清洗作業將改由鄰近工廠接手。
部分工廠雖未直接受災，仍因供應鏈與物流受阻被迫停產。豐田汽車（Toyota Motor）宣布，自 30 日晚間起至 31 日，福岡縣 3 座工廠暫停生產。雖然工廠一度於 30 日上午恢復運作，但考量物流情況等因素，再度決定停工，是否於下週恢復仍待評估。
日產汽車九州公司（Nissan Motor Kyushu）也決定，自 31 日下午起至當天結束，暫停福岡縣苅田町工廠部分生產線運作。公司表示，生產設備並未受損，但因零組件供應中斷，不得不調整生產。
日本經濟同友會代表幹事、IBM 日本公司社長山口明夫 30 日表示，一旦供應鏈遭到破壞，必要零件與產品無法順利交付，整體經濟產出將明顯停滯。他表示，目前正與當地企業保持聯繫，了解是否有可提供支援之處。
