據中央社報導，中秋連假第二天，總統賴清德行程滿檔，上午先至嘉義、台南，下午前往花蓮馬太鞍溪等地，視察颱風丹娜絲及後續豪雨災區復原與重建情形。總統府表示，這趟巡視目的是確保嘉南一帶屋頂修繕、家園重建，以及花蓮堤防、便橋和街道復原工作落實到位，協助災民早日恢復安定生活。

在嘉義東石，賴總統關心災民房屋修繕進度。截至 10 月 2 日，嘉義縣已有 6878 戶申請慰助金，行政院編列 3.6 億元特別預算，協助住宅拆除、修繕與媒合補助。在中央與地方合作下，房屋修復已有階段性成果。總統也探視84歲吳進三，他的屋頂在颱風中受損，施工團隊於 8 月中旬進場，5 天內完成修復。吳進三表示，修好後「不用再遇到颱風、大雨就跑到廟裡」，感到安心。

隨後，賴總統到花蓮馬太鞍溪地區視察重建工程，包括前進指揮所、佛祖街與光復街等，了解堤防修復、便橋重建與側溝清淤進度。總統指出，考量南部災情，中央與地方工程團隊進駐嘉南協助屋頂修繕，同時號召營造公司與公益團體參與，經濟弱勢居民修繕費用由政府全額支出，務求加速復原並確保施工品質。

針對網路評論質疑花蓮馬太鞍溪處置，據中央社報導，中央災害應變中心表示，自 9 月 21 日成立以來已舉行 28 次會報，並依台大團隊模擬疏散最大範圍 1837 戶。馬太鞍橋沖毀時，交通部已實施封橋管制，多元訊息同步發布，確保居民安全撤離。中央指出，部分片段畫面被扭曲報導，將依法追究。

中央災變中心強調，災後復原持續進行中，總統視察與中央行動協調凸顯中央地方合作，保障災民安全與生活恢復。行政院也在 9 月初宣布擴大補助措施，包括增加復原慰助金、媒合修繕簽約獎勵及延長修繕期限，期盼讓災民儘快回到安定生活。