戰爭不只造成人命及財產損失，砲火無眼，同時也會讓地貌、自然景觀受損。加薩地區在以色列與哈瑪斯持續衝突下，環境已蒙受重大破壞，水源等日常所需資源受到各種物質汙染，進一步加深了該地人道危機。

《衛報》報導，衛星圖顯示，加薩地區約有38%至48%的樹木植被及農地受損，大量林地被砲火夷為平地，地下水體受到彈藥及毒素汙染，出海口也受到下水道汙水、廢棄物影響，而武器硝煙、人造物被擊毀產生的粉塵，則使地區空氣品質惡化。

研究組織及環境團體相信，戰火帶來的環境損害，將對加薩走廊生態系穩定及生物多樣性產生負面影響。其影響程度之大、範圍之廣，甚至出現將此行為比擬為「生態屠殺」（ecocide）的用詞，並建議將此視為戰爭罪行。不過以色列國防軍反擊表示，一切行動皆遵守國際法且有試圖避開農地及林地。

不只是直接破壞導致的環境傷害，由於缺乏燃油，民眾須透過砍伐樹木取得燃料來滿足烹飪、取暖需求，也導致樹木減少。這讓原本是橄欖園、果園以及農地之處，先是經過砲火的狂轟濫炸、軍用車輛直接壓過，後又受到民眾搶奪生火材料，最後淪為光禿禿的廢地。

倫敦大學金匠學院研究小組鑑證建築（Forensic Architecture，FA）分析，去（2023）年10月7日戰爭爆發前，加薩地區的農地、果園約有170平方公里，佔整個區域47%。到了今年2月底，已有至少65平方公里遭到以軍破壞，很多地區已形同廢墟，再也無法使用。

事實上，儘管對外宣稱會控制自然衝擊，以色列軍隊曾不只一次表明要讓部分區域的破壞永久化，在以色列與加薩走廊間建立一個無人居住的緩衝帶。這一塊區域大部分曾屬於加薩居民的農業地帶，即使未被破壞，也被以色列鏟地重建的基礎建設取代，像是運送軍用物資的道路等。

另一方面，聯合國環境署（UNEP）也警告，人類居住區遭受轟炸破壞，除了彈藥本身使用的物質會導致汙染外，原本人造物釋出的石棉、重金屬及各種工業化學物質皆會對土壤、地下水與空氣產生負面影響。據聯合國統計，被毀的建築界於50%至62%間，並因此產生了超過2,290萬公噸的廢料。

根據〈國際刑事法院羅馬規約〉（Rome Statute），在知情狀況下發動會對自然環境造成長期、大面積且嚴重破壞的攻擊，屬於戰爭罪。〈日內瓦公約〉（Geneva Convention）也有類似的內容。英國雷丁大學國際法講師Saeed Bagheri表示，雖然現階段各界對這些條文如何適用仍無定論，各界應有足夠證據去發起對加薩地區環境破壞的調查。

FA也認為，巴勒斯坦人強烈仰賴他們的土地及海洋以從事各項維生的生產活動，以色列的行為已經直接剝奪了這些人生產食物的能力，這無疑是一種「生態屠殺」。